Activité 2004-2006

Rapport d’activité 2004-2006

Projets Internes au Centre de Recherche en Cancérologie de Marseille, CRCM

- Identification de Biomarqueurs en Cancérologie, Plusieurs projets en cours (A. Gonçalves, JP Borg)
- Recherche de protéines associées aux mécanismes de polarité planaire, (JP Borg et al)
- Etude des interactions kinases – PDZ, (S. Audebert et JP Borg)
- Etude des voies de signalisation associées au récepteur Tyrosine-kinase Kit, identification des protéines et analyses des phosphorylations, (Collaboration P. Sepulveda, S. Lopez, A. Chaix)
- Recherche d’interacteurs de la protéine de Co-stimulation Icos, (Collaboration J. Nunès, C. Fos)
- Identification de protéines associées aux facteurs de Co-stimulation PD1 et BTLA, (Collaboration D. Olive, N. Seriari)
- Recherche de complexes associés à la protéine Mémo ; implication dans la migration cellulaire, (Collaboration A. Badache. S. Aresta).
- Recherche de protéines Associés au facteur de transcription SP1, rôle des phosphorylations, (Collaboration B. Kahn-Perlès)
- Identification de complexes associés aux facteurs de différenciation NacA (Collaboration S Gomez, L. Stuhl)
- Identification de complexes associés aux facteurs de transcription (J. Imbert, F. Rosa)
- Etude de la voie de Signalisation dérégulée Chop-FGFR (D. Birnbaum, H. Lelievre)

Projets Externes en collaboration, CRCM

Régionaux
- Recherche de protéines associées à CD 146, F. Vely, La Timone, Marseille
- Recherche de complexes impliquées dans la polarité épithéliales (collaboration A . Lebivic, D Massey-Laroche, IBDM, Marseille)

Nationaux
- Identification de protéines impliquées dans l’adressage basolateral du TSH récepteur. (Collaboration O. Lahuna, Le kremlin Bicetre, Paris)

Internationaux
- Identification de protéines impliquées dans l’angiogénèse (Collaboration L. Holmgren, M. Ernswick, Department of Oncology, Karolinska Institute, Stockhom, Sweden)
- Identification de protéines associées aux protéines de jonctions cellulaires JAM (Collaboration M. Aurrand-Lions, CMU, Department of Pathology and Immunology, Geneve, Suisse)

Projets Internes au Centre d’Immunologie de Marseille Luminy, CIML

- Etude préalable à la mise en place de la 2DEDiGE : Comparaison des leucémie aigüe lymphoblastique T (LAL-T), B (LAL-B) et de leucémie aigüe myeloïde (LAM). P.Ferrier, D.Payet, V.Asnafi
- Analyse protéomique de mutants murins : Souris Coronine 1A KO. P.Ferrier, B.Mugnier
- Cartographie protéique de la niche de réplication de Brucella Abortus. JP.Gorvel, E.Fugier
- Etude des substrats de la kinase lck dans les cellules thymiques. B.Malissen, C.Houde

Projets Externes en collaboration, CIML

Régionaux
- Comparaison de souche virulente et avirulente de Rickettsia prowazekii par approche DiGE (CNRS UMR 6020, Marseille, Collaboration D.Raoult et N.Pelletier)

Nationaux
- Proto-oncogènes HOX11 et HOX11L2 : Mécanisme d’action dans la transformation leucémique aigüe lymphoblastique T (LAL-T) (laboratoire d’hémathologie, Hôpital Necker Paris, Collaboration V.Asnafi et E.Macintyre)

Internationaux

Contrats

Evolution, veille technologique

- Mise en place de la technologie DIGE sur la plateforme par Matthieu Pophillat à la suite des premiers tests initiés par D.Payet et V.Asnafi.Lire la suite
- Developpements informatiques Lire la suite

Formation, animation scientifique et technologique

Formations dispensées

2006 Décembre - Atelier protéomique IFR137.

Formations suivies

2006 Juin - Matthieu et Samuel ont assisté à la journée bioinformatique de la proteomique.

Animation scientifique et technologique

2006 Juin - Rencontre des plateformesprotéomique PACA. Première édition organisée par le CAPM Nord.